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세 번째 시즌 첫 에피소드는 시즌 2로부터 3년 후 치명적이고 전염성이 강한 독소에 목숨을 잃은 시체가 공공장소에 버려지면서 시작된다. 그러고 이어지는 요구; 악명 높은 마약왕을 감옥에서 풀어주지 않으면, 치명적인 바이러스를 널리 퍼트리겠다는 것이다. 이제는 테러 방지단에서 특수 지역 작전팀을 이끄는 잭은 초읽기를 시작한 시한폭탄과도 같은 바이러스의 위협을 추적하기 시작한다.