新造シークエスト完成

21世紀初頭に軍事目的から遺伝子工学によって生み出された人工生命体ダガー。だが平和な時代にあって、彼らは忌むべき存在として恐れられ、遺伝子コロニーの一画にある“ダガー・アイランド”に閉じ込められていた。誕生から21年目を迎えようとしていたダガーたちは遂に反乱を起こし、全世界へ宣戦を布告。新たな乗組員を迎え出航の準備が行われていた新造シークエストは事態の終息を図るためダガー・アイランドへ急行するが、その間にダガーたちはＵＥＯ本部を急襲した。ブリッジャーはダガーのリーダー、マライアへ和解を申し込むが、人間への復讐に燃えるダガーたちはレーザー衛星をコントロールして地球全土の酸素を供給している酸素生成プラントを破壊し始めていた……。