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CIA und FBI sind in Alarmbereitschaft, da die Drohungen mit dem nahenden neuen Jahrtausend zunehmen. O’Neill und Soufan führen eine Razzia in einer al-Qaida-Zelle in Brooklyn durch. Die CIA enthält dem FBI weiterhin entscheidende Informationen vor, während sie verdächtige Personen verfolgt, die in die USA einreisen.